本門診主要工作：
職業病科是評估職業傷病與工作相關性及開立職業病專科之診斷明，提供申請職業傷病可休假天數及該次疾病就醫費用補助；繼而協助工廠進行復工與配工。判讀所有年度勞工健康檢查報告；對新進員工健康與工作適任度評估；及由勞動部授權評判年度勞工特殊作業體格及健康級數。連結醫療資源與政府資源，協助個案取得應有的權益。提供勞資雙方最實際、及時與有效的職業傷病服務。
本科也接受工廠的邀請，定期入廠探訪進行職業病淺在風險評估，衛教現場工作人員以及安全管理的建議。職業病醫師訪廠的員工疾病處理可直接帶回醫院進行更詳細的檢查治療或轉介他科轉診開刀、復健治療及中醫治療；後續收集所有醫治資料進行評估開立職業病相關的診斷證明書和職傷病申請。另一方面尋找疾病源頭，解除工作中隱患，對員工身心的保障工廠的營運貢獻良多。
很多人問職醫和廠醫有何不同 ? 職醫可包攬所有的工廠服務，尤其「特殊類別作業第一和第二類工廠」法規之工廠。另外勞工健康保護規則第21條分級規定<勞工特殊健檢分級>也須由職醫科醫師評定。本科最終目標是希望提供勞資雙方完整一條龍的方便服務。
所謂職業病是指由工作引起的疾病。常見的職業病有：
１.肌肉骨骼疾病：
包括肌腱、肌肉、韌帶、神經、關節、骨骼的扭傷、挫傷、發炎、及慢性傷害等。
２.職業肺疾病：
包括各種塵肺症如石棉肺症、矽肺症、煤肺症等，及氣喘症如職業性哮喘、棉花肺症、過敏性肺泡炎，此外如窒息或刺激性氣體引起的肺疾、傳染性肺疾、及肺癌等。
３.職業引起的癌症：
至少有六十五種化學物品是確知的致癌物，並有將近二百種化學物品是極可能的致癌物，大部分都在工業上用到。
４.意外性傷害：
工作中外傷，其中百分之三十是嚴重的傷害，如斷肢、骨折、嚴重裂傷、中毒、燒傷、或失去視力等。重要的是，這些傷害是可以設法預防或減少的，包括在工作程序上去除傷害的可能性、個人安全裝備、工具及場所的改善、以及對工作者的教育等方法。上下班發生之意外，亦屬於職業傷害。
５.職業引起的心臟血管疾病：
化學物質如二硫化碳、二氯甲烷、一氧化碳、硝化甘油等，都曾被報告為可以造成心臟傷害。物理物質，如高溫、狹小工作空間可以加重心臟的負擔，而噪音則與高血壓症有關。但在過度加班及不規律輪班後，若發生了中風或心肌梗塞，亦屬工作所促發之急性心臟血管疾病。
６.噪音引起的聽覺受損：
長期每天暴露於90 分貝以上的工人，四分之一會有聽覺受損。通常是逐漸惡化,而一旦受損，聽覺不會自己恢復，目前也無法以醫療方法治愈。
７.皮膚疾患：
慢性職業疾病之中，相當大比率是皮膚疾病，包括最常見的接觸性皮膚炎、以及如高溫或化學物燒傷、皮膚癌、化學品造成的皮膚染色、氯粉刺、髮根炎、及慢性振動傷害等。
８.精神疾病：
工作壓力引起的心理問題近年來逐漸受重視，如心身症，憂鬱症等。若在工作外傷之後，引起『創傷後壓力症候群』(post-traumatic stress disorder)，亦可能被判為職業相關之疾病。
